ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR812
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGAATAAAACGAATGGTCAA miRNA* GAACGTTAATCTTATTCAAAA mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
TACTCCCTCCTTCCTTAAATATTTGACGCCGTTAACTTTTTTAAATATGTTTGAACGTTAATCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTCTTTTCC
TATCATTTGATTCATTGTTAAATATACTACTACTACTCAAGTTTTTGAATAATATTCACAAAATTTTTGAATAAAACGAATGGTCAAACATGTTTAAAAA
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR806h: 4e-36 PMRD oru-miR806: 3e-43 microPC miR806: 2e-32 | UniProt no hits RFAM MIR806: 2e-97 | most similar mature miRNAs |
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